Будучи в камере стазиса в Атлантиде после двух месяцев, Карсон Беккет - или, более точно, клон покойного доктора, созданный Майклом - возвратился домой на Землю для некоторого R&R. Теперь он возвратился в Атлантис, и призван, чтобы присоединиться к Полковнику Шеппарду на посещении другой планеты.

Шеппард и Беккет идут через иностранный лес на свидание с другой командой, которой командует майор Анна Тельди. Также на команде - Капитан Алисия Вега (Лила Саваста), жесткий сержант Дасти Уэллс, и симпатичный доктор Элисон Портер. Команда позвала Шеппарда и доктора Беккета затем, чтобы видеть то, что они нашли: лаборатория Майкла, скрытая в сети подземных пещер, с дюжиной гуманоидов формирующихся вдоль стены.

Беккет и Портер изучают лабораторию и состояние "пациентов". Тельди, Вега и Шеппард - изучают местность. (Полковник упоминает, что I.O.A. колеблется восстанавливать космическую промежуточною станцию Мидвей, недавно разрушенную Рейфами "Промежуточная станция (Midway)".)

Присутствие людей в камерах стазиса поднимает собственный недавний опыт Карсона, побуждая его сказать доктору Портеру о том, что случилось, когда он обнаружился на пороге его матери спустя два года после его собственных похорон. Эти два ученых начинают подписывать обязательства.

Команда решает временно обстроится в соседней деревне - хотя они не имеют никакого представления, что есть силы поблизости, которые сговариваются против них. И гуманоиды Майкла собираются пробуждаться.

"Слова, произносимые шепотом" в настоящее время намечается как седьмой эпизод пятого сезона, и как ожидают, пойдет перед камерами в апреле.