Джон Шеппард был похищен. Он приходит в сознание, находясь в лесу на материке новой планеты Атлантиды, к которой город был перемещен полутора годами ранее ("Единственная надежда"). Его руки и ноги связаны, и Шеппард пересовывает себя к острой скале, чтобы попробовать освободить себя. Вернувшись в город, Ричард Вусли встречает нового члена экспедиии, она представляется как Доктор Ванесса Конрад, ученый который недавно прибыл на Аполлоне. Вусли немедленно пытается ей всё обьяснить, ломает весь лед рассказывая ей об обыденных занятиях на Атлантисе - турнирах Яхтзи, просмотрах фильмов, спортивных соревнованиях и.т.д.
Полковнику Шеппарду все-таки удается освободить себя, и он осторожно возвращается к Джамперу. Скоро он обнаруживает, что связал его: Акастус Коля (бывший командир военных подразделений дженаев), которого он застрелил два года назад ("Невменяемый").
В Атлантиде, Вулси, МакКей и остальная часть команды собираются сделать шокирующие открытие - открытие о древней расе.
думать можно о многом но узнаем когда будет эта серия 
